Uploaded image for project: 'Mahout'
  1. Mahout
  2. MAHOUT-1892

Can't broadcast vector in Mahout-Shell

    Details

    • Type: Bug
    • Status: In Progress
    • Priority: Critical
    • Resolution: Unresolved
    • Affects Version/s: 0.12.2
    • Fix Version/s: 0.13.2
    • Component/s: None
    • Labels:
      None

      Description

      When attempting to broadcast a Vector in Mahout's spark-shell with `mapBlock` we get serialization errors. *NOTE* scalars can be broadcast without issue.

      I did some testing in the "Zeppelin Shell" for lack of a better term. See https://github.com/apache/zeppelin/pull/928
      The `mapBlock` same code I ran in the spark-shell below, also generated errors. However, wrapping a mapBlock into a function in a compiled jar https://github.com/apache/mahout/pull/246/commits/ccb5da65330e394763928f6dc51d96e38debe4fb#diff-4a952e8e09ae07e0b3a7ac6a5d6b2734R25 and then running said function from the Mahout Shell or in the "Zeppelin Shell" (using Spark or Flink as a runner) works fine.

      Consider

      ```
      mahout> val inCoreA = dense((1, 2, 3), (3, 4, 5))
      val A = drmParallelize(inCoreA)

      val v: Vector = dvec(1,1,1)
      val bcastV = drmBroadcast(v)
      val drm2 = A.mapBlock() {
      case (keys, block) =>
      for(row <- 0 until block.nrow) block(row, : -= bcastV
      keys -> block
      }

      drm2.checkpoint()
      ```

      Which emits the stack trace:

      ```
      org.apache.spark.SparkException: Task not serializable
      at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:304)
      at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.org$apache$spark$util$ClosureCleaner$$clean(ClosureCleaner.scala:294)
      at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.clean(ClosureCleaner.scala:122)
      at org.apache.spark.SparkContext.clean(SparkContext.scala:2032)
      at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$map$1.apply(RDD.scala:318)
      at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$map$1.apply(RDD.scala:317)
      at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:147)
      at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:108)
      at org.apache.spark.rdd.RDD.withScope(RDD.scala:310)
      at org.apache.spark.rdd.RDD.map(RDD.scala:317)
      at org.apache.mahout.sparkbindings.blas.MapBlock$.exec(MapBlock.scala:33)
      at org.apache.mahout.sparkbindings.SparkEngine$.tr2phys(SparkEngine.scala:338)
      at org.apache.mahout.sparkbindings.SparkEngine$.toPhysical(SparkEngine.scala:116)
      at org.apache.mahout.math.drm.logical.CheckpointAction.checkpoint(CheckpointAction.scala:41)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:58)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:68)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:70)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:72)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:74)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:76)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:78)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:80)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:82)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:84)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:86)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:88)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:90)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:92)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:94)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:96)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:98)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:100)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:102)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:104)
      at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:106)
      at $iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:108)
      at $iwC$$iwC.<init>(<console>:110)
      at $iwC.<init>(<console>:112)
      at <init>(<console>:114)
      at .<init>(<console>:118)
      at .<clinit>(<console>)
      at .<init>(<console>:7)
      at .<clinit>(<console>)
      at $print(<console>)
      at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
      at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
      at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
      at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
      at org.apache.spark.repl.SparkIMain$ReadEvalPrint.call(SparkIMain.scala:1065)
      at org.apache.spark.repl.SparkIMain$Request.loadAndRun(SparkIMain.scala:1340)
      at org.apache.spark.repl.SparkIMain.loadAndRunReq$1(SparkIMain.scala:840)
      at org.apache.spark.repl.SparkIMain.interpret(SparkIMain.scala:871)
      at org.apache.spark.repl.SparkIMain.interpret(SparkIMain.scala:819)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.reallyInterpret$1(SparkILoop.scala:857)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.interpretStartingWith(SparkILoop.scala:902)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.command(SparkILoop.scala:814)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.processLine$1(SparkILoop.scala:657)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.innerLoop$1(SparkILoop.scala:665)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.org$apache$spark$repl$SparkILoop$$loop(SparkILoop.scala:670)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop$$anonfun$org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process$1.apply$mcZ$sp(SparkILoop.scala:997)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop$$anonfun$org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process$1.apply(SparkILoop.scala:945)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop$$anonfun$org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process$1.apply(SparkILoop.scala:945)
      at scala.tools.nsc.util.ScalaClassLoader$.savingContextLoader(ScalaClassLoader.scala:135)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process(SparkILoop.scala:945)
      at org.apache.spark.repl.SparkILoop.process(SparkILoop.scala:1059)
      at org.apache.mahout.sparkbindings.shell.Main$.main(Main.scala:37)
      at org.apache.mahout.sparkbindings.shell.Main.main(Main.scala)
      Caused by: java.io.NotSerializableException: org.apache.mahout.sparkbindings.drm.CheckpointedDrmSpark
      Serialization stack:

      • object not serializable (class: org.apache.mahout.sparkbindings.drm.CheckpointedDrmSpark, value: org.apache.mahout.sparkbindings.drm.CheckpointedDrmSpark@2d1c2fe7)
      • field (class: $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC, name: A, type: interface org.apache.mahout.math.drm.CheckpointedDrm)
      • object (class $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC, $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC@291be813)
      • field (class: $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$anonfun$1, name: $outer, type: class $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC)
      • object (class $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$anonfun$1, <function1>)
      • field (class: org.apache.mahout.sparkbindings.blas.MapBlock$$anonfun$exec$2, name: bmf$1, type: interface scala.Function1)
      • object (class org.apache.mahout.sparkbindings.blas.MapBlock$$anonfun$exec$2, <function1>)
        at org.apache.spark.serializer.SerializationDebugger$.improveException(SerializationDebugger.scala:40)
        at org.apache.spark.serializer.JavaSerializationStream.writeObject(JavaSerializer.scala:47)
        at org.apache.spark.serializer.JavaSerializerInstance.serialize(JavaSerializer.scala:84)
        at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:301)
        ... 66 more
        ```

        Attachments

          Issue Links

            Activity

              People

              • Assignee:
                Andrew_Palumbo Andrew Palumbo
                Reporter:
                rawkintrevo Trevor Grant
              • Votes:
                0 Vote for this issue
                Watchers:
                3 Start watching this issue

                Dates

                • Created:
                  Updated: